Der Bodenfonds des Gebiets Tomsk beträgt 316,9 Tsd. km².

Der Hauptteil des Territoriums ist mit Wäldern bedeckt (54,2 %). Der Wasserfonds nimmt 2,5 %, landwirtschaftliche Landereien nehmen 4,4 %, Sumpfgebiete – 29,1 %, übrige Gebiete - 9,8 % des Gebietsterritoriums ein. Die Mehrheit landwirtschaftlicher Landereien liegt im Süden des Gebiets: Rayons Tomskij, Koshewnikowskij, Schegarskij und Syrjanskij. Der Hauptteil des Ackers liegt in Rayons Koshewnikowskij und Tomskij.