Das Gebiet Tomsk hat reiche Vorräte an Naturressourcen: Erdöl, Erdgas, Eisenerz, Torf u.a. Geologische Erdöl -, Erdgasanfangsressourcen betragen mehr als 5,4 Mrd. Bezugstonnen (1 Öltonne ist 1000 m³ Gas gleichgestellt und beträgt 1 Tonne Bezugskohlenwasserstoffe). Das Erdinnere des Gebiets Tomsk enthält mehr als 57 % der Eisen -, 18 % der Zirkonium -, 9 % der Titan -, 6 % der Aluminium -, 5 % der Braunkohlen -, 4 % der Zinkvorräte der Russischen Föderation sowie große Untergrundwasservorräte. Im Südosten des Gebiets befinden sich die für Gold – und Antimongewinnung prospektive Gebiete. Hier liegen auch Vorkommen verschiedener nichtmetallischer Bodenschätze. Es gibt große Vorräte am Kiessand, Ziegellehm, Silikat – und Quarzsand, Sapropel, und Torf.