Als am Ende des 19. Jahrhunderts die bekannte Transsibirische Eisenbahn von Ural bis zum Pazifik gebaut wurde, ist Tomsk etwas abseits der Haupteisenbahn geblieben.

Das Gebiet ist bis heute mit der  Transsibirischen Eisenbahn durch den 90 km langen Bahnzweig verbunden. Die günstige geografische Lage des Gebiets, d.h. das Zentrum des Eurasiens ermöglicht aber recht bald das Gebiet aus der Transportsackgasse herauszuführen.

In der Entwicklungsstrategie des Verkehrsnetzes Russlands spielt das Gebiet Tomsk eine wichtige Rolle und tritt als eine Brücke auf, die die Erdöl- und Erdgasgewinnung im Norden des Landes und die sich schnell entwickelnde Wirtschaft im Südosten Asiens verbindet. Zurzeit wird die Nördliche Fernverkehrsstraße weitergebaut, die die Funktion eines Verkehrskorridors erfüllt und Kusbass sowie die Region Krasnojarsk mit dem autonomen Bezirk Chante–Mansijsk und mit dem Territorium des mittleren Urals verbindet. Derzeit geht die Arbeit an dem Projekt des Baus der Verkehrsbahn zu Ende, die schon den Nahmen der zweiten Transsibirischen Eisenbahn bekommen hat und solche Städte wie  Enisejsk- Belyj Jar- Nizhnewartowsk- Surgut verbindet.

Durch das Territorium des Gebiets Tomsk sind Gas- und Erdölpipelines gebaut, denen eine wichtige Funktion in der Realisation des strategischen Projekts des Baus des Pipelines „Ostsibirien-Pazifik“ und des Pipelines „Jamal- China“ zugeschrieben wird. In den kommenden Jahren wird geplant, den Pipelinetransport zu modernisieren, um dessen Durchsatzfähigkeit zu vergrößern. Das Investitionsprogramm beträgt 1 Mlrd. Rubel.

Eine der vorrangigen Aufgaben der Gebietsverwaltug ist weitere Entwicklung des Flußverkehrs sowie des Flugwesens. Tomsk verfügt über einen modernen Flughafen,  von dem Flüge nach Moskau (Flugzeit 3.50), Nowosibirsk, Sotschi und in andere Städte Russlands gemacht werden. Im Jahr 2006 wird die Frage nach der Eröffnung des internationalen Sektors im Tomsker Flughafen erörtert.

Die Entwicklung der modernen Informations- und Kommunikationstechnologien ist noch eine gute Möglichkeit die Verkehrsisolation des Gebiets zu überwinden.  Das Gebiet Tomsk zählt zu den führenden Regionen Russlands nach der Entwicklung der IT- Branche. Nach der Verbreitung des Internets gehört das Gebiet Tomsk zu den fünf führenden Regionen Russlands, der Verbreitung des Mobilfunkes nach- zu den zehn Ragionen-Leaders. Im Gebiet ist das System des Festnetzes gut ausgebaut. Im Gebietszentrum werden im Jahr 2006 zu den schon vorhandenen Mobilfunksformaten GSM neue Technologien eingeführt, solche wie CDMA und die Möglichkeiten des kabellosen Internetanschlusses WiMax eingeführt.

In Tomsk entwickeln sich rasch Firmen, die  Kabel TV Dienstleistungen anbieten,  und jetzt Tausende Stadteinwohner haben die Möglichkeit solche Fernsehkanäle wie BBC, DW, EuroNews, EuroSport, TV5Monde, Discovery, insgesamt mehr als 50 Fernsehkanäle zu sehen. Außerdem wurde in Tomsk ein Projekt des Übergangs auf  digitales Fernsehen erarbeitet, was seinerseits für das Gebiet möglich macht in den internationalen Informationsraum zu integrieren.