DieVollzugsmacht ist  die Administration der Region Tomsk. Seit 1991 bekleidet den Posten des Chefs der Gebietsadministration Tomsk (des Gouverneurs des Tomsker Gebietes) Herr Viktor Melchiorowitsch Kress zuerst von dem Präsidenten Russlands ernannt und  1995, 1999 sowie 2003  von der Bevölkerung gewählt.

Die gesetzgebende Macht ist die Staatsduma des Gebietes Tomsk, zum ersten Mal 1994 gewählt. Der ständige Speaker ist Herr Boris Alexejewitsch Maltsew.

Das Gebietsgericht Tomsk leitet Herr A. A. Kaigorodow.

Das Schiedsgericht des Gebiets Tomsk leitet seit seiner Gründung im April 1992 Alexander Fjodorowitsch Skutin.